Der Münchner MotettenChor wurde im Jahre 1960 von Hans Rudolf Zöbeley gegründet. Er ging aus einer kleinen Gruppe musikbegeisterter Studenten an der Universität München hervor, die sich in der Absicht zusammengefunden hatte, eine Vorlesung über Motetten von Heinrich Schütz - daher der Name des Chores - musikalisch zu illustrieren. Der Erfolg und die Freude des gemeinsamen Musizierens waren so groß, dass man sich entschloss weiterzumachen. Die ersten Konzerte wurden in der evangelischen Bischofskirche St. Matthäus in München veranstaltet, wo der Chor auch heute noch regelmäßig Gottesdienste der Gemeinde und der evangelischen Landeskirche musikalisch gestaltet.

Im Laufe der Jahre erweiterte der inzwischen stark vergrößerte Chor systematisch sein Repertoire, das heute nahezu die gesamte Bandbreite der Chorliteratur aus über vier Jahrhunderten umfasst. Heute gehören dem Ensemble rund 120 Sängerinnen und Sänger an, so dass die unterschiedlichen Werke stets in der passenden Besetzung aufgeführt werden können. Da der Chor seit vielen Jahren regelmäßig in den großen Konzertsälen Münchens auftritt, wurde er zu einer festen Größe im Musikleben der bayerischen Landeshauptstadt.

Seit 1998 ist Hayko Siemens künstlerischer Leiter des Münchner MotettenChores. Seine musikalische Konzeption stellt sicher, dass der Chor seine über Jahre erarbeitete Programmstruktur fortentwickelt und eine Repertoire-Vielfalt pflegt, vor der vergleichbare Ensembles eher zurückweichen.